кого простуда подкосила?

[Outlawif]

С ложноотрицательными все еще банальнее, Андрей верно говорит. Просто такова надежность теста.

[andreyyy]

ну тут все же есть момент помимо чувствительности самой системы, еще и в специфике локализации при разных заболеваниях.

Для короны вот как и ранее говорили и сейчас напоминают, отрицательный в верхних дыхательных путях - не гарантия отсутствия вируса в нижних.

или в кишечнике, если через клизму в больнице заражение )

 

Это не совсем очевидно, ведь обычно начинаются респираторные сверху и лишь потом опускаются

[Outlawif]

Как ответил бы ты "это все уже зашито в понятие надежности теста" ) Имеется в виду не пцр-методология в принципе, а конкретно пцр-тест на сарс-ков-2.

[andreyyy]

ааа

[OlegRO]

Это какая-то совсем экзотическая транспортировка должна быть

по укр дорогам просто)

[andreyyy]

Не все маски одинаково хороши. А ещё их часто не хватает. В ответ на дефицит СИЗ (средств индивидуальной защиты), ставший острой проблемой во время пандемии COVID-19, учёные из Гарвардского университета (Harvard University) и Массачусетского технологического института (MIT, МТИ) создали новую версию масок, эффективно защищающих от вирусных частиц. В дизайне прототипа использованы экспериментальные технологии, которые позволят производить больше масок из меньшего количества сырья — и, вполне возможно, спасти больше жизней.

 

Показать

 

Показать

Новый прототип под названием iMASC был создан на основе маски N95, которую широко используют врачи и парамедики. N95 — это респиратор, не пропускающий частицы патогенов и различных химических веществ, содержащиеся в воздухе. В отличие от хирургических масок, N95 плотно прилегает к лицу и изготовлена из полипропиленовых волокон, способных отфильтровывать 95% частиц. Маски N95 — одноразовые, их необходимо выбрасывать или утилизировать после каждого контакта с пациентами и вирусными аэрозолями. Именно по этой причине в разгар пандемии COVID-19 возник их острый дефицит.

 

«Мы понимали, что для удовлетворения спроса мы должны создать средства защиты, которые люди смогут без лишних сложностей использовать на местах. В то же время, мы хотели максимизировать возможность повторного использования масок, а также их стерилизации различными способами», — комментирует Джованни Траверсо (Giovanni Traverso), гастроэнтеролог из Brigham and Women’s Hospital при Гарварде, также преподающий машиностроение в МТИ.

 

Результатом усилий команды учёных и инженеров стал прототип, который в настоящее время проходит второй этап разработки. Это многоразовая силиконовая маска со сменными фильтрами из полипропилена, повторное использование которой после стерилизации, в теории, обеспечивает такой же уровень защиты, как и N95. Один или два фильтра вставляются в переднюю часть силиконовой маски. При этом, для изготовления фильтров требуется гораздо меньшее количество полипропилена, чем для N95, состоящей из него практически полностью.

 

Разработчики предполагают, что данная модель может стать новым «золотым стандартом». Дефицит СИЗ во время пандемии вынудил многих врачей и медработников прибегать к непроверенным способам очистки и многократного использования одноразовых масок или же мастерить самодельные защитные средства в ожидании новых поставок. Это не лучший выход для людей, которые каждый день спасают жизни других — таким образом они рискуют подвергнуть опасности себя, своих близких и пациентов. Новая экспериментальная маска способна решить данную проблему.

 

«Такая конструкция позволяет менять использованные фильтры, расходуя и утилизируя гораздо меньше защитного материала, чем в масках N95», — комментирует материаловед из МТИ Адам Уэнтуорт (Adam Wentworth).

 

При создании защитной системы iMASC использовалось компьютерное 3D-моделирование поведения и деформации силиконовой маски при ношении на лицах разных форм и размеров.

 

По расчётам разработчиков, стоимость такой маски не будет превышать 7$, а фильтры обойдутся, примерно, по 50 центов за шт. Таким образом, iMASC после всего 10 использований станет выгоднее, чем N95, стоящие в США 1$ за шт.

 

Для тестирования применимости iMASC в реальных условиях, разработчики попросили 20 работников больниц примерить и проверить новые маски согласно стандартному тесту Управления по безопасности и гигиене труда. Проверка прошла успешно — все маски легко надевались, достаточно плотно прилегали и пропускали воздух. Замена фильтров также не вызвала затруднений.

 

Разработчики протестировали различные способы стерилизации силиконовых масок — пропаривание, нагревание в духовке, замачивание в отбеливателе и изопропиленовом спирту. Маски, прошедшие через эти манипуляции, не подверглись никаким изменениям или повреждениям, кроме незначительных отличий в текстуре силикона.

 

Опираясь на полученную обратную связь, разработчики в настоящее время приступили к тестированию второй версии маски. Если его результаты покажут, что система сменных фильтров действительно эффективна для фильтрации вирусных частиц, iMASC с большой вероятностью станет первым представителем нового поколения средств индивидуальной защиты.

[OlegRO]

все эти экспериментальные вещи, супер аэрозоли, уф-лампы и т.д. - для укров как вести с Плутона

[andreyyy]

тоже об этом всегда думаю, читая о передовых достижениях в медицине

 

для поддержания разговора, не более

[OlegRO]

не в тему, но

сразу двое знакомых занялись импортом списанного медоборудования из Европы

у них из-за ковида повыделяли бабла да нагрузили заводы мед-техники, всё меняют массово

[andreyyy]

Статья А.Панчина.

Не медицина. К болезням-лечениям отношения не имеет, но по традиции связанное с сарс-ков-2 тащу сюда

 

Необычные мутации коронавируса

 

Сегодня в рецензируемом научном журнале PeerJ у нас вышла статья по актуальной теме – публикация посвящена тому, как мутирует коронавирус, захвативший мир.

 

Прежде чем объяснять суть статьи напомню некоторые базовые вещи из курса молекулярной биологии (если вы владеете темой – переходите сразу к следующему абзацу). Итак, молекула ДНК представляет собой двойную спираль. Каждая из спиралей – это цепочка из четырех типов нуклеотидов, обозначаемых буквами A,T,G,C. В двойной спирали А ставится напротив Т, а G напротив С. Это называется принципом комплементарности, и он позволяет молекуле ДНК размножаться. Двойная спираль расплетается, и к каждой отдельной цепочке достраивается вторая по этому принципу. В итоге получается две двойные спирали. Копирование ДНК не идеально: иногда возникают случайные опечатки – мутации. Кроме того, с ДНК по этому же принципу комплементарности считываются одноцепочечные молекулы РНК, тоже состоящие из нуклеотидов. Нуклеотиды РНК обозначают буквами A,U,G,C. При синтезе РНК U ставится напротив А. Молекулы РНК используются для синтеза белков.

 

SARS-CoV-2 – вирус, наследственный материал (геном) которого представлен положительной, то есть используемой для синтеза белков, цепочкой РНК. ДНК у вируса нет. Мы заинтересовались, как изменился характер мутагенеза SARS-CoV-2 после того, как он перескочил к людям. Для этого мы взяли около тысячи полностью прочитанных геномов SARS-CoV-2 и посмотрели на этих данных относительные частоты уникальных одиночных мутаций, когда один нуклеотид A,U,G или C меняется на другой. Поскольку речь идет о разновидностях вируса человека, то все такие мутации произошли в ходе распространения вируса среди людей.

 

Для сравнения мы посмотрели на одиночные нуклеотидные замены между SARS-CoV-2 и родственными вирусами летучих мышей. Биоинформатические методы позволяют реконструировать предковый геном вируса. Отличия от этого предкового генома представляют собой замены, которые произошли до того, как вирус стал заражать людей. Аналогичные расчеты мы выполнили для двух других коронавирусов, которые перескочили от животных к людям: вируса атипичной пневмонии (SARS-CoV) и коронавируса HKU1.

 

Если посмотреть на относительное число нуклеотидных замен разного типа в ранней эволюционной истории SARS-CoV-2 до заражения людей, сложно заметить что-то особенное. Частоты таких замен похожи на аналогичные у SARS-CoV и HKU1. Это хорошо согласуется с работами, указывающими на естественное происхождение вируса.

 

Но после перехода к человеку у SARS-CoV-2 происходит удивительная вещь: примерно в десять раз увеличивается доля мутаций G в U. Причем такого эффекта не наблюдается для SARS-CoV или HKU1. Сначала мы думали, что это может быть ошибкой, но оказалось, что результат воспроизводится независимо от того, каким методом читались геномы, используем ли мы геномы из США или Китая, надежности мутационных данных и так далее.

 

Что еще более удивительно: мы не видим симметричного увеличения числа комплементарных мутаций C в А. Как я уже говорил, геном SARS-CoV-2 представлен положительной цепочкой молекулы РНК. Когда вирус заражает клетку, положительная цепь используется для синтеза отрицательных цепей, которые в свою очередь используются для синтеза новых положительных цепей, которые упаковываются в оболочки и передаются следующим клеткам. Нуклеотидам A,U,G,C на положительной цепи соответствуют нуклеотиды U,A,C,G на отрицательной. Если бы избыток мутаций G в U возникал за счет ошибок копирования РНК, то такие ошибки, вероятно, возникали бы при копировании как положительных, так и отрицательных цепей. Мутации G в U на отрицательной цепи – это C в А на положительной. Но избытка таких мутаций мы не видим. Выходит, одна из цепей должна мутировать избирательно.

 

Как такое возможно? В статье мы приводим одно возможное объяснение, аккуратно отмечая его недоказанный, гипотетический характер. Мы знаем, что предок SARS-CoV-2 жил в летучих мышах, которые в процессе эволюции выработали массу молекулярных механизмов, защищающих их клетки от окислительного стресса. Считается, что это позволяет летучим мышам без симптомов распространять массу вирусов, которые вызывали бы тяжелые болезни у других животных.

 

Известно, что окислительный стресс приводит к избытку мутаций G в Т в ДНК, за счет формирования 8-оксигуанинов. Это такие неправильные буквы G. В норме в ДНК напротив G ставится C, но напротив 8-оксигуанинов могут ставиться как C так и А. Затем напротив А ставится Т, а это и значит, что исходное G поменялось на Т. Есть работы, показывающие, что 8-оксигуанины могут аналогичным образом вносить ошибки при синтезе РНК.

 

Теперь представим, что на поздних этапах заражения клеток человека возникает как пик синтеза положительных цепей SARS-CoV-2, так и пик окислительного стресса, ведущего к высокому содержанию 8-оксигуанинов в РНК. Именно положительные цепи, обогащенные 8-оксигуанином, передадутся следующим клеткам. Отрицательные цепи, даже если они тоже обогатятся 8-оксигуанином, никуда не передадутся. Поэтому мы увидим только то, как на положительных цепях G заменяется на U. Но я еще раз повторю, что это только гипотеза. Кроме того нас удивляет, что мы не видим такого же эффекта в случае с вирусом атипичной пневмонии.

 

Сформулирую выводы кратко: мутагенез SARS-CoV-2 изменился после заражения людей весьма интересным способом – возможно, из-за того, что вирус оказался в новой для себя среде. Никаких намеков на то, что в эволюцию вируса кто-то вмешивался искусственно, в данных по заменам мы не видим.

 

[1] Panchin AY, Panchin YV. 2020. Excessive G–U transversions in novel allele variants in SARS-CoV-2 genomes. PeerJ 8:e9648